Baja por enfermedad siendo autónomo: cuánto cobras y desde qué día

Si eres autónomo y caes enfermo, la Seguridad Social no te paga desde el minuto uno. Cobras a partir del cuarto día de baja (enfermedad común) o desde el día siguiente si es accidente de trabajo, y el importe ronda el 60-75% de tu base de cotización, no de lo que factura tu negocio.

Qué es la baja por enfermedad del autónomo y a quién afecta

Cuando un autónomo no puede trabajar por enfermedad o accidente, entra en situación de incapacidad temporal (IT), la misma figura que existe para los asalariados pero con reglas distintas de gestión y de pago. La cotización por contingencias comunes es obligatoria para todo autónomo desde 2019 (RETA), así que en principio todos tienen derecho al subsidio. La cobertura por contingencias profesionales (accidente de trabajo y enfermedad profesional) es voluntaria salvo para actividades de especial riesgo, según la normativa de la Seguridad Social.

Te afecta si:

• Estás dado de alta en el RETA y al corriente de pago de cuotas.
• Tienes cubierto un periodo mínimo de cotización por contingencias comunes: 180 días dentro de los 5 años anteriores a la baja, salvo que la incapacidad derive de accidente (ahí no se exige periodo previo).
• La baja la extiende tu médico de familia (enfermedad común) o la mutua colaboradora (accidente de trabajo o enfermedad profesional, si tienes esa cobertura contratada).

Desde qué día se cobra y cuánto

Aquí está la parte que más confunde a los autónomos: el dinero no llega desde el día 1.

Enfermedad común o accidente no laboral - Días 1 a 3: sin prestación económica. No cobras nada salvo pacto o mejora voluntaria (rara en autónomos). - Días 4 a 20: 60% de la base reguladora. - Día 21 en adelante: 75% de la base reguladora.

Accidente de trabajo o enfermedad profesional (solo si tienes cubiertas contingencias profesionales) - Desde el día siguiente al del hecho causante: 75% de la base reguladora, sin carencia de 3 días.

La base reguladora es la media de tu base de cotización de los meses previos, no tu facturación ni tu beneficio. Si cotizas por la base mínima, el subsidio será modesto; si cotizas por una base más alta dentro del sistema de tramos por ingresos reales vigente desde 2023, el importe sube en proporción.

Ejemplo real: Rubén es electricista autónomo en Valencia y cotiza por una base de 960 €/mes (tramo 4 del sistema de ingresos reales). Coge la gripe y su médico le da 10 días de baja por enfermedad común. Los 3 primeros días no cobra nada. Del día 4 al 10 (7 días) cobra el 60% de su base reguladora diaria: 960 €/30 = 32 €/día, el 60% son 19,20 €/día, unos 134,40 € en total para esa semana. Si la baja se hubiera alargado más de 20 días, a partir del día 21 pasaría a cobrar el 75%, unos 24 €/día.

Tabla comparativa: enfermedad común vs accidente de trabajo

Paso a paso para tramitar la baja

1. Acude al médico o a la mutua. Si es enfermedad común, el parte lo emite tu médico de familia del Servicio Público de Salud. Si es accidente de trabajo y tienes cubiertas contingencias profesionales, acudes a la mutua colaboradora con la que cotizas esa cobertura.
2. El parte médico se transmite de forma electrónica al INSS y, si procede, a la mutua gestora de la prestación económica. No tienes que llevar papeles a la Seguridad Social como antes.
3. Comunica la baja a tu mutua o al INSS si no lo hace automáticamente el sistema; en la práctica, muchas mutuas piden que rellenes un formulario de solicitud de la prestación con tus datos bancarios.
4. Cesa la actividad. Si tienes empleados o encargos en curso, tienes que organizar quién cubre el trabajo, pero tú, como autónomo de alta, no puedes seguir facturando trabajo propio durante la IT.
5. Cobra el subsidio. Normalmente lo abona directamente la mutua o el INSS mediante transferencia, con cierto retraso respecto al inicio de la baja (las primeras nulas suelen tardar unas semanas en regularizarse).
6. Si la baja supera los 60 días, puedes solicitar la exoneración del pago de la cuota de autónomos a partir del día 61, trámite que se pide expresamente a la Tesorería General de la Seguridad Social (TGSS); si no lo pides, sigues pagando la cuota mensual con normalidad.
7. Alta médica. Cuando el médico o la mutua te da el alta, reanudas la actividad y dejas de percibir el subsidio.

Qué pasa con la cuota de autónomos mientras estás de baja

Aquí hay un error habitual: pensar que la baja médica exime automáticamente de pagar la cuota. No es así. La cuota se sigue devengando desde el día 1 de la baja. Solo a partir del día 61 de IT ininterrumpida puedes pedir la exoneración de la cuota, y solo si la pides expresamente; no se aplica de oficio. Si tu baja dura, por ejemplo, 25 días, pagas la cuota íntegra ese mes como si hubieras trabajado con normalidad.

Errores habituales

• Creer que se cobra desde el día 1. Los 3 primeros días de enfermedad común no se pagan, algo que pilla a muchos por sorpresa cuando ven la primera nómina de la mutua.
• Seguir facturando durante la baja. Emitir facturas o realizar trabajos mientras estás de IT puede interpretarse como incompatibilidad con el subsidio y da lugar a su suspensión y, en algunos casos, a la obligación de devolver lo cobrado.
• No pedir la exoneración de cuota pasados 60 días. Muchos autónomos con bajas largas siguen pagando la cuota mes tras mes sin saber que pueden solicitar la exoneración a la TGSS.
• No tener cubiertas las contingencias profesionales cuando la actividad tiene riesgo real (construcción, transporte), lo que deja fuera la protección reforzada del 75% desde el primer día en caso de accidente.
• No cotizar por una base ajustada a los ingresos. Con el sistema de tramos por ingresos reales, elegir la base mínima "para pagar menos" reduce también el subsidio de IT, la base reguladora de la jubilación y otras prestaciones.

Cuándo conviene un profesional

Si la baja se prevé larga (más de un mes), si hay dudas sobre si el accidente es laboral o no, o si tienes empleados a tu cargo que necesitan reorganizarse mientras estás de baja, merece la pena que un gestor o asesor laboral revise tu situación concreta: qué base tienes, si te conviene o no pedir la exoneración de cuota, y cómo declarar ese periodo en el IRPF del ejercicio.

Nuestra recomendación: revisa tu base de cotización pensando también en estos escenarios, no solo en el importe mensual de la cuota. Cotizar por lo mínimo abarata el día a día, pero deja un colchón muy pequeño si te toca estar de baja varias semanas. Y si tu actividad tiene riesgo físico real, valora contratar la cobertura de contingencias profesionales aunque sea voluntaria: la diferencia entre cobrar el 60% desde el día 4 o el 75% desde el día siguiente al accidente se nota mucho en la cuenta corriente.

Para trámites y comprobar tu situación concreta, la referencia oficial es la Seguridad Social, en https://www.seg-social.es. Los datos de cotización y bases pueden cambiar cada año, así que comprueba siempre el importe vigente antes de hacer tus propios cálculos.